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寻找第K大数的方法
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-10 热度:136
寻找一堆数中第K大的数,第一感觉是排序,然后将排序之后的值取第K个。但是实际上,这种方式最少的时间复杂度是O(nlogn)。有更简单的方式可以实现线性的时间复杂度。 算法总是有穷尽的,而思想无穷尽,而实用算法的本质是用空间去换取时间。 这里的方案是:[详细]
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《hadoop进阶》PeopleRank从社交关系中挖掘价值用户
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-09 热度:114
转载请注明出处: 转载自? Thinkgamer的CSDN博客: blog.csdn.net/gamer_gyt 代码下载地址:点击查看 1:PageRank 与 PeopleRank 2:需求分析:挖掘CSDN博客的价值用户 3:算法模型:PeopleRank算法 4:架构设计:从数据准备到PR算法的MR化 5:程序开发:had[详细]
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XTU 1247 Robb#39;s Problem
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-09 热度:162
Robb’s Problem [ Submit Code ] [ Top 20 Runs ] Acceteped : 48 ? Submit : 335 Time Limit : 1000 MS ? Memory Limit : 65536 KB ? Description Robb’s Problem 题目描述 Robb想知道阶乘 n ! 第 m 位数码是什么? 输入 第一行是一个整数 T , ( 1 ≤ T[详细]
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基因数据处理38之dbSnpId到omimId的映射表
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-09 热度:155
1.下载: 首先收到【2】,来源是【2】 【1】中有描述: You can also get those SNPs with an OMIM ID number by downloading from the dbSNP FTP site: the OmimVarLocusIdSNP table contains the information you need for your organisim of interest (hu[详细]
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基因数据处理39之mango安装记录
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-09 热度:87
更多代码请见:https://github.com/xubo245/AdamLearning 1解释 mango安装记录 mango主要是在adam上实现 可视化平台 A scalable genome browser 2.代码: git clone https: //github.com/bigdatagenomics/mango.git cd mangomvn clean package -DskipTests[详细]
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51NOD 1116 K进制下的大数(字符串取模 + 枚举)
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-09 热度:198
传送门 1116 K进制下的大数 基准时间限制:1 秒 空间限制:131072 KB 分值: 20 难度:3级算法题 收藏 关注 有一个字符串S,记录了一个大数,但不知这个大数是多少进制的,只知道这个数在K进制下是K - 1的倍数。现在由你来求出这个最小的进制K。 例如:给出的[详细]
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poj3181 Dollar Dayz (DP+大数)
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-09 热度:190
Dollar Dayz Crawling in process... Crawling failed Time Limit: 1000 MS???? Memory Limit: 65536 KB???? 64bit IO Format: %I64d %I64u Submit Status Practice POJ 3181 Appoint description: System Crawler (2016-05-27) Description Farmer John goe[详细]
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基因数据处理40之bedtools的安装和使用
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-09 热度:139
1.下载: git clone https: //github.com/arq5x/bedtools.git 2.编译: make 3.配置: cp * /usr/local /bin/ 4.运行: bam变成bed hadoop @Master :~/xubo/data/snap $ bamToBed -i datatest.sorted.bam datatest.sorted.bed 查看: hadoop @Master :~/xubo[详细]
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基因数据处理44之cloud-scale-bwamem安装
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-08 热度:119
cloud-scale-bwamem是在spark等云环境上实现bwa-mem算法,加速对全基因组匹配的处理 1.下载: git clone https: //github.com/ytchen0323/cloud-scale-bwamem.git 2.编译: mvn clean package 3.编译成功: [INFO] ----------------------------------------[详细]
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基因数据处理50之cs-bwamem、bwa、snap、bwa-mem与art比较
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-08 热度:118
直接看结果: (1)art仿真数据: hadoop @Master :~/cloud/adam/xubo/data/GRCH38Sub/cs-bwamem $ cat G38L100c50Nhs20 .aln ##ART_Illumina read_length 100 @CM art_illumina -ss HS20 -i GRCH38chr1L3556522 .fna -l 100 -c 50 -o G38L100c50Nhs20 -rs 1[详细]
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基因数据处理45之cloud-scale-bwamem安装(compile.pl安装有问题
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-08 热度:152
脚本: hadoop @Master :~/xubo/tools/cloud-scale-bwamem $ cat compile.pl #! /usr/bin/perl system "mvn clean package" ;chdir "./src" ;system "mvn package -PotherOutputDir" ;chdir "./main/jni_fpga" ;system "mvn package -PotherOutputDir" ;chdi[详细]
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??攻略|13招神技 让你在数据科学和数据分析工作中脱颖而出
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:87
简介:我有幸在很早参与了一个大数据科学项目,我非常喜欢其中的工作,甚至我意识到我的努力可以增加一些公司的价值。 然而,可悲的是,只有不到30%的数据科学项目最终实施了。我备受打击的意识到我的努力被浪费了。但是,我不是唯一的一个。几乎,每一个分[详细]
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基因数据处理46之cloud-scale-bwamem安装(compile.pl安装没问题
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:151
版本:https://github.com/ytchen0323/cloud-scale-bwamem/releases/tag/v0.2.1 1.需要设置spark路径: !--systemPath/cluster/spark/spark-1.3.1-bin-hadoop2.4/lib/spark-assembly-1.3.1-hadoop2.4.0.jar/systemPath -- systemPath /home/hadoop/cloud/spa[详细]
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基因数据处理51之cs-bwamem集群版运行*
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:77
将master的local改为集群就可以了。 集群运行结果: 问题: 匹配50条的时候,bwa和snap都是生成50条。但是cs-bwamem会生成492条,其中25和50条重读的很多,匹配位置不同。不知道为啥? 记录: D: 1 win7javajdkbinjava -Didea.launcher.port= 7538 "-Di[详细]
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《剑指offer》:[16]打印1到最大的N位数
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:191
题目:输入数字N,按顺序打印从1到最大的n位十进制数。比如输入3,则打印出1、2、3一直到最大的三位数即:999. 乍一看这个题目很简单,我们很快就会写出下面的代码: void onetoN(int n){int number=1;for(int i=0;in;i++){number*=10;}for(int i=1;inumber;[详细]
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基因数据处理52之cs-bwamem集群版运行(1千万条100bp的reads)
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:73
1.art生成模拟序列: art_illumina -ss HS20 -i GRCH38BWAindex/GRCH38chr1L3556522 . fna -l 100 -c 10000000 -o g38L100c10000000Nhs20 2.上传到hdfs,制定partition数 spark-submit --class cs .ucla .edu .bwaspark .BWAMEMSpark --master spark://maste[详细]
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NDK开发 - JNI数组数据处理
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:103
很多时候利用 NDK 开发都是为了对数据进行加密操作,因为单纯的 Java 太容易被反编译了,加密算法也就很容易被破解,而利用 C/C++ 开发可以加大破解难度。文件的数据加密就需要通过 byte 数组传给 JNI。 传送门: NDK开发 - JNI数组数据处理 JNI 中的数组分[详细]
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利用BI搭建零售业数据信息平台
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:119
某百货公司是全市规模最大的以零售为主、多元化经营的股份制商业企业。拥有员工数千人,经营国内外品牌2300余种,年商品销售额逾10亿人元。 销售体量如此庞大的企业近几年在IT建设上出现了问题,集团内部的信息化数据有些跟不上业务扩张的步伐。虽然该集团很[详细]
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BZOJ 1670 [Usaco2006 Oct]Building the Moat护城河的挖掘
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:86
Description 为了防止口渴的食蚁兽进入他的农场,Farmer John决定在他的农场周围挖一条护城河。农场里一共有N(8=N=5,000)股泉水,并且,护城河总是笔直地连接在河道上的相邻的两股泉水。护城河必须能保护所有的泉水,也就是说,能包围所有的泉水。泉水一定在[详细]
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基因数据处理70之Picard安装没成功
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:93
1.下载: https://github.com/broadinstitute/picard.git 2.安装: hadoop@Master:~/xubo/tools/picard$ ant clone-htsjdkBuildfile: /home/hadoop/xubo/tools/picard/build.xmlclone-htsjdk: [exec] Cloning into 'htsjdk'... [echo] Checking out HTSJDK t[详细]
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OBIEE RPD开发
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:79
A parent-child hierarchy is a hierarchy of members that all have the same type. This contrasts?with level-based hierarchies,where members of the same type occur only at a single level of the?hierarchy. The most common real-life occurrence[详细]
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基因数据处理41之mango使用失败
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:75
hadoop@Master:~/xubo/tools/adam- 2.10 - 0.19 -git/bin$ mango-submit /xubo/mango/snap/datatest .fa .adam -read_files /xubo/mango/snap/datatest2 .sort .bam .adam -var_files /xubo/mango/snap/datatest2 .flt .vcf .adam -feat_file /xubo/mango/sn[详细]
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基因数据处理42之mango问题_seqdict.avro不存在解决
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:62
参考【1】中问题解决 问题分析:这是新版本的问题:adam0.19.1目前在maven中心仓库没有 解决办法: package org.gcdss.test import java.io.File import java.nio.file.Files import org.apache.parquet.hadoop.metadata.CompressionCodecName import org.ap[详细]
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推荐系统技术之文本相似性计算(三)
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:157
今天这篇也比较长,但中间有部分是代码,7,8,9最后三节的信息我认为较为有用。 前面说了两篇了,推荐系统技术之文本相似性计算(一)和推荐系统技术 --- 文本相似性计算(二)分别介绍了 TFIDF 和向量空间的相关东西,然后介绍了 主题模型 ,这一篇我们就[详细]
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趣图:论修电脑和当医生的相似性
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:58
(点击 上方公众号 ,可快速关注) 既然喝水这么重要,今天来送个福利 ↓↓↓ 据路边社报道,水杯离你越近,喝水的频率将会越高。 借今天的趣图,来团一款方便携带的随手水杯。emoi 品牌,环保,外观设计简洁大方,手感也很不错。密封防漏做的好,可随身携带[详细]
